楽天市場への発送完了報告(API)を利用しています。出荷確定処理を行う前に楽天側のステータスを[発送済]にした注文も、発送完了報告の処理対象になりますか?

処理対象になります。対象となる条件は下記をご参照ください。

■発送完了報告の処理対象となる条件

・受注ステータスが[出荷済み](受注状態コード:50)

・受注伝票の「発送伝票番号」に配送番号が登録されている(※)

※配送番号が不要な発送方法の場合、別途設定を行うことで受注伝票の「発送伝票番号」が空欄でも処理対象にすることが可能です。(設定方法は下記マニュアル参照)