Shopifyにてマルチロケーションを削除せずに在庫連携する方法はありませんか?

複数のロケーションを利用している場合、どのような方法でも在庫連携は行えません。

Shopify用自動連携アプリでは、ロケーションごとの在庫数を管理することができません。
このため、ロケーションが複数登録されていた場合は在庫連携の対象外となります。

※Shopifyのロケーションを削除するためには、まず「無効化」する必要があります。

※ロケーションの無効化や削除方法は下記よりShopify側のマニュアルをご参照ください。