ヤフーオークションで落札された受注伝票をキャンセルしたら、ヤフーオークション側もキャンセルされますか。

Yahoo!オークション側のステータスと連携していないため、キャンセルされません。
別途Yahoo!オークション側の管理画面にてキャンセル処理を行ってください。