本システム側とWowma!側の差出人メールアドレスを一致させないと、自動送信メール機能は使えないのでしょうか。

一致していない場合でも、本システムの自動送信メール機能を利用することは可能です。

ただし、一致していないことによりWowma!の「メール履歴の機能」を利用できません。